Version 1.11
Hepatitis E Virus Genotyping Tool
Example Sequences
Version 1.11
Start using our new user interface: Genome Detective Platform
Example Sequences
>AB245932|HE-JANGP89|
ggctgaggaggaggctacttccggtctggtaatgctttgtattcatggctctcctgttaattcctatactaatacaccttacaccggtgcactagggctccttgactttgcattagagcttgaatttagaaatttgacacccgggaacactaacactcgtgtttcccggtacaccagcacagctcgccatcggctgcgccgtggtgctgatgggaccgctgagcttaccaccacagcggccacacgcttcatgaaggacttgcattttactggcacgaacggcgttggtgaggtgggtcgtggtatcgctctgacactgtttaacctcgctgatacgcttctcggtggtttaccgacagaattgatttcgtcggccgggggtcagctgttttactcccgccctgttgtctcg
>AB265194|HE-Aichi-C1|
tcagtttataaaggctcctggcgtcactactgctatcgagcaggcagctctagcagcggccaactccgccctggcgaatgctgtggtggttcggcctttcctatctcggctacagacagaaatcctgattaacctgatgcagccccggcagcttgtctttcggcctgaggttctatggaaccacccaatccagcgcgtaatccataacgagcttgagcagtattgccgagctcgcgctggtcgctgccttgaggtgggggcccacccgcgctccattaatgacaatcccaatgttctgcaccgttgttttctgaagcctcgtggtcgcgacgtccagcggtggtacactgccccaacccgcggccccgcagcgaattgccgccgatcggctctccgtgggcttccacctgtt
>AB290071|swMN06-A1293|
ggctgaagaggaggccacttccggtttggtgatgctctgcatccatggctcccctgttaattcttatactaacacccctccgttgcctcccgtcgtcgatctgccccagctggggctgcttgattttgcattagagcttgagtttaggaacctaacacccgggaatactaatacccgtgtatcccggtacacaagcacagcccgccaccggctgcgccgcggtgccgacrgtaccgctgagcttaccaccatggcagccacgcgctttatgaaggacttgcattttaccggcacaaatggggttggtgaggttggccgcggtatcgctctaactttattcaatcttgctgacacgcttcttggtggtttgccgacagaattaatttcgtcggcagggggtcagttgttctactcccgccctgtcgtctca
>AB222087|HepE3
AGGTATGGCCGTAGAACGAAATTATATGAGGCGGCACATTCAGATGTTCGTGAGTCCCTAGCTAGGTTCATCCCCACTATCGGGCCTGTTCAGGCCACCACATGTGAGTTGTATGAGTTGGTTGAGGCCATGGTGGAGAAGGGTCAGGACGGCTCTGCCGTCCTAGAGCTTGACCTTTGCAATCGTGACGTCTCGCGTATCACATTTTTCCAAAAGGATTGCAATAAATTCACAACTGGTGAGACTATTGCCCATGGCAAGGTTGGCCAAGGTATATCGACCTGGAGTAAGACCTTCTGTGCCCTGTTTGGCCCGTGGTTCCGCGCCATAGAAAAAGAGATATTGGCCCTGCTCCCGCCTAATATCTTTTATGGCGACGCTTATGAAGAGTCAGTGTTTGCTGCCGCTGTGTCTGGGGCGGGGTCATGTATGGTATTTGAAAATGATTTTTCGGAATTTGACAGTACTCAGAATAACTTCTCTCTCGGCCTTGAGTGTGTGGTCATGGAGGAGTGCGGCATGCCCCAGTGGTTGATTAGGTTGTACCATCTGGTTCGGTCAGCCTGGATTTTGCAGGCGCCGAAGGAGTCTCTTAAGGGTTTTTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCTGGTACCCTTCTCTGGAACACCGTCTGGAACATGGCGATTATAGCGCACTGTTACGAGTTCCGTGACTTTCGCGTTGCCGCCTTCAAGGGTGACGATTCGGTGGTCCTTTGCAGCGACTATCGGCAGAGCCGCAATGCGGCTGCCTTAATTGCAGGCTGTGGGCTCAAATTGAAGGTCGATTATCGCCCTATTGG
ggctgaggaggaggctacttccggtctggtaatgctttgtattcatggctctcctgttaattcctatactaatacaccttacaccggtgcactagggctccttgactttgcattagagcttgaatttagaaatttgacacccgggaacactaacactcgtgtttcccggtacaccagcacagctcgccatcggctgcgccgtggtgctgatgggaccgctgagcttaccaccacagcggccacacgcttcatgaaggacttgcattttactggcacgaacggcgttggtgaggtgggtcgtggtatcgctctgacactgtttaacctcgctgatacgcttctcggtggtttaccgacagaattgatttcgtcggccgggggtcagctgttttactcccgccctgttgtctcg
>AB265194|HE-Aichi-C1|
tcagtttataaaggctcctggcgtcactactgctatcgagcaggcagctctagcagcggccaactccgccctggcgaatgctgtggtggttcggcctttcctatctcggctacagacagaaatcctgattaacctgatgcagccccggcagcttgtctttcggcctgaggttctatggaaccacccaatccagcgcgtaatccataacgagcttgagcagtattgccgagctcgcgctggtcgctgccttgaggtgggggcccacccgcgctccattaatgacaatcccaatgttctgcaccgttgttttctgaagcctcgtggtcgcgacgtccagcggtggtacactgccccaacccgcggccccgcagcgaattgccgccgatcggctctccgtgggcttccacctgtt
>AB290071|swMN06-A1293|
ggctgaagaggaggccacttccggtttggtgatgctctgcatccatggctcccctgttaattcttatactaacacccctccgttgcctcccgtcgtcgatctgccccagctggggctgcttgattttgcattagagcttgagtttaggaacctaacacccgggaatactaatacccgtgtatcccggtacacaagcacagcccgccaccggctgcgccgcggtgccgacrgtaccgctgagcttaccaccatggcagccacgcgctttatgaaggacttgcattttaccggcacaaatggggttggtgaggttggccgcggtatcgctctaactttattcaatcttgctgacacgcttcttggtggtttgccgacagaattaatttcgtcggcagggggtcagttgttctactcccgccctgtcgtctca
>AB222087|HepE3
AGGTATGGCCGTAGAACGAAATTATATGAGGCGGCACATTCAGATGTTCGTGAGTCCCTAGCTAGGTTCATCCCCACTATCGGGCCTGTTCAGGCCACCACATGTGAGTTGTATGAGTTGGTTGAGGCCATGGTGGAGAAGGGTCAGGACGGCTCTGCCGTCCTAGAGCTTGACCTTTGCAATCGTGACGTCTCGCGTATCACATTTTTCCAAAAGGATTGCAATAAATTCACAACTGGTGAGACTATTGCCCATGGCAAGGTTGGCCAAGGTATATCGACCTGGAGTAAGACCTTCTGTGCCCTGTTTGGCCCGTGGTTCCGCGCCATAGAAAAAGAGATATTGGCCCTGCTCCCGCCTAATATCTTTTATGGCGACGCTTATGAAGAGTCAGTGTTTGCTGCCGCTGTGTCTGGGGCGGGGTCATGTATGGTATTTGAAAATGATTTTTCGGAATTTGACAGTACTCAGAATAACTTCTCTCTCGGCCTTGAGTGTGTGGTCATGGAGGAGTGCGGCATGCCCCAGTGGTTGATTAGGTTGTACCATCTGGTTCGGTCAGCCTGGATTTTGCAGGCGCCGAAGGAGTCTCTTAAGGGTTTTTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCTGGTACCCTTCTCTGGAACACCGTCTGGAACATGGCGATTATAGCGCACTGTTACGAGTTCCGTGACTTTCGCGTTGCCGCCTTCAAGGGTGACGATTCGGTGGTCCTTTGCAGCGACTATCGGCAGAGCCGCAATGCGGCTGCCTTAATTGCAGGCTGTGGGCTCAAATTGAAGGTCGATTATCGCCCTATTGG